Группа была основана в 1989 году под названием «Morbid God» параллельно с не получившим развития проектом «Archangel» (Фернанду Рибейру - ударные, Ares - вокал, остальные участники скоро покинули группу). Первые репетиции группы проходили в здании, принадлежащем городскому совету их родного посёлка Брандоа, а первая записанная песня именовалась «The Fever». Позже к Morbid God присоединился гитарист Mantus, и в этом составе музыканты выпустили одну демозапись (Serpent Angel, 1992). После записи Serpent Angel Moonspell были приглашены независимым лейблом MTM принять участие в сборнике португальских металических групп. В том же году участники сменили название на Moonspell. После выпуска очень удачного EP «Under the Moonspell» на «Adipocere Records», на котором Moonspell предстали блэк-метал-группой с очень заметным фолковым оттенком, карьера группы пошла вверх. В 1994 году Moonspell выступали на разогреве у Cradle of Filth в Лиссабоне, а затем подписали контракт с Century Media. На этом лейбле Moonspell выпустили дебютный альбом Wolfheart (1995). После выпуска дебютника последовало турне с Morbid Angel в качестве «разогревающей» группы. В 1995 - 1996 годах Moonspell выступали в Чехии, Польше и Германии. Следующий альбом, Irreligious, принес ещё больший успех, а видеоклип на песню «Opium», который был снят на старых улицах Лиссабона, демонстрировался по европейскому телевидению. 12 июля 1996 года Moonspell выступили в старинном монастыре Convento do Beato. Телеканал VIVA признал в 1996 году Moonspell открытием года (другими номинантами были Korn и Marilyn Manson).

В 1997 году выходит мини-альбом Second Skin, который содержал кавер-версию композиции Depeche Mode «Sacred». На следующих альбомах — Sin/Pecado и The Butterfly Effect - Moonspell начали экспериментировать со звучанием, добавив элементы электронной музыки, что было неоднозначно воспринято многими поклонниками. В 1998 году участники Moonspell (кроме барабанщика Майка Гаспара) создали сайд-проект «Daemonarch» и под этим названием записали блэк-металический альбом «Hermeticum» (1998).

В 2004 год у группа записала кавер-версию джазовой песни «I’ll See You in My Dreams» для саундтрека к одноименному португальскому триллеру. На эту песню был снят видеоклип с фрагментами фильма.

После разрыва с Century Media Moonspell подписали контракт на запись трех альбомов с SPV/Steamhammer. Первым альбомом стал Memorial (2006), который был заметно тяжелее предыдущих работ, но в первую же неделю возглавил португальский чарт. и вывел Moonspell в число самых популярных португальских исполнителей всех направлений. На две песни с альбома — «Finisterra» и «Luna» — были сняты видеоклипы. В 2007 году предполагался выпуск DVD Lunar Still/13 Years of Doom, но выход DVD на Century Media не состоялся из-за юридических проблем.

Ещё одним крупным успехом Moonspell стала победа в номинации «Лучший исполнитель из Португалии» на состоявшейся 2 ноября 2006 году в Копенгагене церемонии MTV Europe Music Awards.

29 июня 2007 года вышел сборник лучших песен группы The Great Silver Eye. Осенью того же года был издан альбом Under Satanæ, в который вошли переиздания работ группы 1992—1994 годов.

В мае 2008 года Moonspell выпустили альбом Night Eternal, правда ещё до официальной даты релиза музыканты выложили альбом на своей странице MySpace. 9 декабря состоялся релиз DVD Lusitanian Metal (новое название давно готовившегося диска Lunar Still/13 Years of Doom).

19 июля 2010 года в продажу поступают марки, выпущенные Португальской почтовой службой (CTT, порт. Correios de Portugal) в честь группы. Данная серия марок посвящена наиболее значительным моментам истории рок-музыки, а также альбомам португальских исполнителей. Группа «Moonspell» представлена альбомом «Wolfheart». Стоимость марки составляет один евро.

27 апреля 2012 года на Napalm Records вышел альбом Alpha Noir. В качестве бонусного материала в deluxe и диджипак-изданиях группа представила, по сути, ещё один полноформатный релиз Ómega White, более мягкий по звучанию и напоминающий о «готических корнях» Moonspell. Студийной работой над обоими дисками занимался Тью Мэдсен, а общее время звучания составляет около 80 минут.

6 марта 2015 года на Napalm Records вышел альбом Extinct.

Текущий состав

Фернанду Рибейру (Fernando Ribeiro; Langsuyar) — вокал (с 1989 г.)
Рикарду Аморим (Ricardo Amorim; Morning Blade) — гитара (с 1995 г.)
Мигел Гашпар (Miguel Gaspar; Mike/Nisroth) — ударные (с 1992 г.)
Педру Пайшау (Pedro Paixão; Passionis/Neophytus) — клавишные, семплы, гитара (с 1994 г.)
Айреш Перейра (Aires Pereira; Ahriman) — бас-гитара

Бывшие участники

Toureiro — ударные (1989—1992 гг.)
Pedro C. — гитара (1989—1992 гг.)
Duarte P. — гитара (1990—1991, 1992—1995 гг.)
Mantus — гитара (1989—1995 гг.)
Жуан Педру (João Pedro; Ares/Tetragrammaton) — бас-гитара (1989—1997 гг.)
Сержиу Крестана (Sérgio Crestana) — бас-гитара (1997—2003 гг.)
Луиш Ламелаш (Luis Lamelas; Malah) — гитара
Никлас Этелявуори (Niclas Etelävuori) — бас-гитара (2003 г.)